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第二軍醫(yī)大學附屬長海醫(yī)院創(chuàng)建于1949年，是一所集醫(yī)療、教學、科研為一體的現(xiàn)代化大型綜合性醫(yī)院。

醫(yī)院占地23.4萬平方米，建筑面積68萬平方米，其中工作用房17.6萬平方米，生活用房10萬平方米，實現(xiàn)了醫(yī)療區(qū)、教學科研區(qū)、生活區(qū)三區(qū)分離?，F(xiàn)擁有病房大樓、科技大樓、醫(yī)技樓、第二醫(yī)技樓、胸心疾病診治大樓、門急診樓、影像診斷中心樓、感染科樓、康賓樓、生殖研究中心樓、制劑樓等布局合理、設施先進的醫(yī)療建筑群，以及供病人休息的“怡園”、“馨園”等環(huán)境優(yōu)雅、景色怡人的場所。醫(yī)院設有科室49個，展開床位1800余張。擁有一批國內(nèi)外知名的專家教授和中青年技術骨干。醫(yī)院現(xiàn)有博士點25個、碩士點40個，并設博士后流動站4個。每年完成醫(yī)療、藥學、護理等專業(yè)和外國留學生共3000多名學生的教學任務。

醫(yī)院特色明顯，60年代以來先后形成肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、創(chuàng)傷外科、血液內(nèi)科、消化內(nèi)科等特色學科。目前擁有**重點學科15個，全軍?？蒲芯克⒅行?3個，全軍重點實驗室2個，上海市臨床醫(yī)學中心2個，上海市醫(yī)學質(zhì)控中心3個，上海市示范學科1個，現(xiàn)為全軍、全國臨床藥理基地。部分研究項目具有國際先進水平。醫(yī)院注重高新技術的創(chuàng)新和運用，在腦血管病防治、血管外科、影像診斷、X線刀、微波治療、腹腔鏡手術、“細胞刀”治療帕金森病、整形整容、準分子激光近視手術、鈥激光治療泌尿系結(jié)石、肛腸疾病診治、放射治療、介入治療、基因治療、創(chuàng)傷救治、房間隔缺損封堵、頸椎脊柱病診治、中晚期肝癌的中西醫(yī)結(jié)合治療及血液凈化等方面各展所長，形成了新的特色。2008年，全院門急診量突破170萬人次，出院病人5.3萬人次，完成手術2.6萬例次。醫(yī)護質(zhì)量穩(wěn)步提高，發(fā)表論文、中標科研基金和科研成果歷年來保持全國各大醫(yī)院領先水平。創(chuàng)辦了《中華胰腺病雜志》和《藥學服務與研究》兩本期刊。

2012年度醫(yī)院科研醫(yī)療成果：泌尿外科孫穎浩領銜的《前列腺癌診療體系的創(chuàng)新及其關鍵技術的應用》獲國家科技進步一等獎，燒傷科夏照帆領銜的《燒傷相關肺損傷系統(tǒng)控制技術的研究與應用》獲國家科技進步二等獎，泌尿外科孫穎浩領銜的《腎癌外科治療與腎癌轉(zhuǎn)移機制的研究》獲上海市科技進步一等獎，胸心外科徐志云領銜的《新型人造心臟瓣膜和瓣膜外科新技術的研究和應用》獲軍隊醫(yī)療成果一等獎，普外六科景在平領銜的《腔內(nèi)微創(chuàng)治療主動脈夾層的臨床研究》獲教育部科學技術進步一等獎，整形外科邢新領銜的《眼瞼重建與下瞼成形臨床研究》獲軍隊醫(yī)療成果二等獎，藥材科高申領銜的《水凝膠釋藥關鍵技術及其產(chǎn)業(yè)化》獲上海市科技進步二等獎。

1993年首批評為三級甲等醫(yī)院。1998年榮膺全國百佳醫(yī)院稱號。連續(xù)13屆獲上海市“文明單位”稱號。

醫(yī)院設備先進，擁有正電子發(fā)射計算機斷層顯像設備(PET)、超高檔螺旋CT3臺、核磁共振(MRI)3臺、數(shù)字減影儀(DSA)4臺、核素掃描儀(ECT)、直線加速器、高壓氧艙、準分子激光治療儀、激光手術刀、全自動生化分析儀及重癥監(jiān)護系統(tǒng)等現(xiàn)代化診療設備。